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Hola Gerardo!

Por aquí estamos todos bien; espero que vosotros estéis bien también

Lo que tienes que hacer en estos casos es usar el botón "marcar los archivos modificados como seguros". Como esos archivos provienen de las actualizaciones, son modificaciones autorizadas, así que con ese botón actualizamos su 'hash' en la BBDD para controlar futuros cambios. 

Las excepciones deben ser usadas muy poco, sólo para algún archivo concreto que cambie con frecuencia. 

Un saludo,
Jose

Todos bien por aquí también muchas gracias.
Entiendo haré lo que me indicas, y procederé con cuidado para añadir las excepciones,
Muchas gracias por tu apoyo
Buen fin de semana

Gracias a ti Gerardo!!

Buen finde,
Jose